Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC107Q8WV48 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms