Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45GIP1Q8TAE8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GADD45GIP1Q8TAE8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms