Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms