Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APPL2Q8NEU8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APPL2Q8NEU8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APPL2Q8NEU8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APPL2Q8NEU8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APPL2Q8NEU8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APPL2Q8NEU8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms