Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LINC00116Q8NCU8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LINC00116Q8NCU8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms