Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM229BQ8NBD8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms