Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB37

GATD1, Glutamine amidotransferase-like class 1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATD1Q8NB37 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GATD1Q8NB37 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GATD1Q8NB37 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms