Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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FAM71DQ8N9W8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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FAM71DQ8N9W8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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FAM71DQ8N9W8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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FAM71DQ8N9W8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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FAM71DQ8N9W8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM71DQ8N9W8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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FAM71DQ8N9W8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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FAM71DQ8N9W8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM71DQ8N9W8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM71DQ8N9W8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM71DQ8N9W8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM71DQ8N9W8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM71DQ8N9W8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM71DQ8N9W8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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FAM71DQ8N9W8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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FAM71DQ8N9W8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM71DQ8N9W8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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FAM71DQ8N9W8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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FAM71DQ8N9W8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM71DQ8N9W8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM71DQ8N9W8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM71DQ8N9W8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM71DQ8N9W8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM71DQ8N9W8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM71DQ8N9W8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM71DQ8N9W8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM71DQ8N9W8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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