Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00612Q8N6U2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms