Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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CLDN19Q8N6F1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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CLDN19Q8N6F1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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CLDN19Q8N6F1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLDN19Q8N6F1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLDN19Q8N6F1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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