Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CKAP2LQ8IYA6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CKAP2LQ8IYA6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms