Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KSR1Q8IVT5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KSR1Q8IVT5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms