Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM139Q8IV31 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM139Q8IV31 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms