Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALYREFQ86V81 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALYREFQ86V81 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms