Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF554Q86TJ5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF554Q86TJ5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF554Q86TJ5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF554Q86TJ5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF554Q86TJ5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF554Q86TJ5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF554Q86TJ5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF554Q86TJ5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF554Q86TJ5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms