Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
KRT28Q7Z3Y7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT28Q7Z3Y7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms