Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SV2BQ7L1I2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SV2BQ7L1I2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms