Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TMUB2Q71RG4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMUB2Q71RG4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms