Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RBM43Q6ZSC3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RBM43Q6ZSC3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms