Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC73Q6ZRK6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC73Q6ZRK6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms