Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TREML4Q6UXN2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms