Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
KCNIP4Q6PIL6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP4Q6PIL6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms