Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EDC4Q6P2E9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EDC4Q6P2E9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms