Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RGMBQ6NW40 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms