Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDE2Q6IQ49 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms