Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETFRF1Q6IPR1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms