Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQQ9

OTUD7B, OTU domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD7BQ6GQQ9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTUD7BQ6GQQ9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTUD7BQ6GQQ9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms