Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA2Q69YH5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA2Q69YH5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA2Q69YH5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDCA2Q69YH5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA2Q69YH5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms