Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CREB3L3Q68CJ9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CREB3L3Q68CJ9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms