Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1DP3Q658K8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EEF1DP3Q658K8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms