Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SHEQ5VZ18 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SHEQ5VZ18 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms