Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM208BQ5VWN6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM208BQ5VWN6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM208BQ5VWN6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM208BQ5VWN6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM208BQ5VWN6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM208BQ5VWN6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM208BQ5VWN6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM208BQ5VWN6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM208BQ5VWN6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM208BQ5VWN6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM208BQ5VWN6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FAM208BQ5VWN6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM208BQ5VWN6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM208BQ5VWN6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM208BQ5VWN6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM208BQ5VWN6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM208BQ5VWN6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM208BQ5VWN6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM208BQ5VWN6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FAM208BQ5VWN6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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FAM208BQ5VWN6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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FAM208BQ5VWN6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM208BQ5VWN6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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