Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOCADQ5VW36 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOCADQ5VW36 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms