Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBXN11Q5T124 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBXN11Q5T124 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms