Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
FRMPD1Q5SYB0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
FRMPD1Q5SYB0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms