Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C10orf55Q5SWW7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C10orf55Q5SWW7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms