Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPL39P5Q59GN2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPL39P5Q59GN2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms