Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DCAF6Q58WW2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DCAF6Q58WW2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms