Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL22Q53GT1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL22Q53GT1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms