Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCBP3Q53F19 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCBP3Q53F19 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms