Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC38Q502W7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC38Q502W7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms