Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TPRNQ4KMQ1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPRNQ4KMQ1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
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