Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SP6Q3SY56 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SP6Q3SY56 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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