Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TYSND1Q2T9J0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms