Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KNOP1Q1ED39 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KNOP1Q1ED39 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
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