Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM187BQ17R55 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM187BQ17R55 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms