Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UPP1Q16831 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UPP1Q16831 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms