Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LAMA3Q16787 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LAMA3Q16787 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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