Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STX1AQ16623 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STX1AQ16623 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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