Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZIC1Q15915 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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